De las visitas registradas, 1.373.750 lo fueron para la colección permanente y 738.877 para las diversas exposiciones temporales, entre las que cabe destacar "Picasso. Tradición y vanguardia", "El trazo oculto", y dos que aún pueden visitarse: "Lo fingido verdadero. Bodegones en la colección Naseiro" o "Dibujos en la Hispanic Society".

A este número habría que añadir el millón de personas (1.008.500) que han visitado las exposiciones itinerantes organizadas por el museo en diversas ciudades españolas y extranjeras, en las iniciativas conocidas como Prado Itinerante y Prado Internacional.

El mayor número de visitantes correspondió a los residentes en la Comunidad de Madrid. No obstante, las posiciones siguientes por lugar de procedencia las ocupan personas procedentes de países tan distantes de España como Estados Unidos y Japón.

Los visitantes extranjeros representaron en torno a un 64% sobre el total, un 4% más que el año anterior, destacando el incremento de japoneses, alemanes y, en término relativos, rusos y chinos sobre 2005. Entre los visitantes nacionales, por detrás de Madrid se sitúan Andalucía, Cataluña y la Comunidad Valenciana.

El perfil sociodemográfico de los visitantes es de una proporción levemente superior de las mujeres sobre los varones (54 y 46% respectivamente), de 25 a 34 años o de 45 a 64 años, con un nivel de estudios superiores, una ocupación profesional y un nivel de renta medio o medio-alto.

Hay una mayor afluencia de jóvenes a las exposiciones temporales que a la colección permanente. En las encuestas de muestreo realizadas, los visitantes han otorgado al Museo una calificación media de notable.