La fundación Madrid 2012 estará regida por un patronato compuesto por patronos institucionales, en representación del Ayuntamiento de Madrid, del Comté Olímpico Español, de la Administración del Estado y de la Comunidad de Madrid.

También forman parte del patronato el presidente del Comité Paralímpico Español, los miembros españoles del Comité Olímpico Internacional, los grupos municipales del Ayuntamiento de Madrid y representantes de las Administaciones municipal, autonómica y estatal, de los sindicatos y de la patronal.