Esta Agencia, por la Ley de Ordenación Sanitaria de la Comunidad de Madrid (LOSCAM) de 21 de diciembre de 2001, tiene dos cometidos a desarrollar: mejorar la formación de los profesionales sanitarios y promover la investigación científica y la innovación tecnológica en el campo de las cienciasde la salud, en coordinación con otras entidades con similares fines.

Para lograr estos objetivos, la Agencia de Formación, Investigación y Estudios Sanitarios será competente en la promoción, ordenación, coordinación, gestión y evaluación de todas las actividades de formación e investigación en ciencias de la salud.

Un director general y un Consejo de Administración conforman los órganos de dirección de la Agencia, que dispondrá de sendos Consejos Científicos Asesores, uno sobre formación profesonal y otros sobre investigación, según informó el Gobierno regional.

Además, y con el fin de elaborar conjunta y coordinadamente los programas respectivos, la Dirección de la Agencia contará con la colaboración de una Comisión de Investigación en Ciencias de la Salud y una Comisión de Formación de Profesionales Sanitarios, que estará asistida por un Comité de Formación Continuada en las áreas de atención primaria y atención especializada, un Comité Regional de Formación de Especialistas Sanitarios y or una red de Comisiones Locales Docentes y Asesoras de Formación de Especialistas Sanitarios.

También dependerán de la Agencia el Centro de Información Bibliográfica y Documentación en Ciencias de la Salud y la Comisión de Formación Continuada de las profesiones sanitarias de la Comunidad de Madrid. En cuanto al régimen económico-financiero, la Agencia de Formación, Investigación y Estudios Sanitarios se someterá al régimen de contabilidad pública y presupuesto formará parte del Presupuesto general d la Comunidad de Madrid.