La creación de esta capitaníasupone la transferencia de las competencias de la autoridad militar a la civil. Las Capitanías Marítimas desempeñarán las funciones que hasta ahora tenían las Comandancias Militares de Marina y Ayudantías Militares.

Estas funciones son el control del personal marítimo y de toda clase de buques, así como el salvamento y protección del medio marítimo en las aguas jurisdiccionales del Estado.

El nuevo capitán marítimo de Gerona es Josep Marsal Bayerri, que coordinará las funciones de las Ayudantías e Marina, que se mantienen con idéntica estructura y competencias.