Estas fundaciones son órganos diseñados para la gestión de programas y proyectos de investigacin clínica y otras actividades relacionadas con la actividad biomédica. Además, son instrumentos que contribuyen a dar mayor flexibilidad, agilidad y dinamismo a las instituciones sanitarias.

La Ley 30/1994 reguló el funcionamiento de estos entes, que se han venido utilizando para la gestión de actividades de investigación, tanto en el sector privado, como en el público.

Las fundaciones hoy aprobadas nacen con competencia estatal, aunque cuando se hayan producido las transferencias, se transformarn automáticamente en fundaciones de ámbito autonómico y pasarán a dependen de cada CCAA.