La distribución de estos fondos se realizará teniendo en cuenta varios requisitos, como la superficie que cada comunidad aporta a la Red Natura 2000 de espacios protegidos de la UE y el número de planes de recuperación de especies que ha puesto en marcha cada una de ellas.

Andalucía es la comunidad que más subvención recibirá, más de 60 millones de pesetas seguida de Castilla y León, con 56 millones; Castilla-La Mancha, con 45; Aragón con casi 35; Cataluña, con 28; Extremadura, con 25; Navarra, con 23, y Galicia, con 19.

Estos fondos están especialmente destinados a apoyar los trabajos encaminados a la conservación y uso sostenible de la biodiversidad.