De estos fondos, se han asignado 12,4 millones de euros para programas ganaderos de control y erradicación de las Encefalopatías Espongiformes Transmisibles (EETs), para programas ganaderos de control para la mejora de la calidad de la leche, para los programas de calidad y trazabilidad de los sectores ganaderos, para el Plan de Ordenación y competitividad del sector lácteo, así como para el Plan de ordenación y fomento del sector equino, y para ayudas al sector avícola de carne.

Por su parte, los programas estatales de control y erradicación de otras enfermedades, contarán con una asignación de 3,4 millones de euros, que se destinarán a las indemnizaciones por sacrificio obligatorio tras el diagnóstico de tuberculosis bovina, así como para el programa coordinado de lucha frente a la enfermedad denominada Aujeszky.

Para las ayudas destinadas a la implantación de sistemas de autocontrol en los mercados de ganado se han asignado 324.000 euros. Se ha tomado en cuenta para el reparto el número de mercados nacionales existentes en cada comunidad autónoma, que además cumplen las exigencias de la normativa de la Unión Europea para intercambio intracomunitario.

Por otro lado, El Gobierno también aprobó el reparto de 25,4 millones de euros entre las comunidades autónomas para las medidas de acompañamiento, así como para las acciones de desarrollo rural referidas a obras de infraestructura y equipamiento.