Según las primeras cifras difundidas hoy por la compañía, la demanda de destino está "muy igualada" entre las ciudades a las que volará Flysur: Barcelona, Vigo, Bilbao y Córdoba. Sin embargo, destaca ligeramente Barcelona como el destino más vendido, aunque también es el más ofertado.

La frecuencia de vuelos de Flysur será de un vuelo diario a Barcelona, mientras que las rutas a Bilbao y Vigo se realizarán en días alternos; de tal forma que los martes, jueves y sábados se establecerá conexión con Bilbao, y los lunes, miércoles, viernes y domingos con Vigo.