Un total de 5.000 enfermedades distintas entarán dentro de este programa, que cubre el período 1999-2003. Estas enfermedades no son investigadas por los grandes laboratorios, debido a que, como las padecen pocas personas, no resulta rentable la investigación necesaria para producir fármacos con los que combatirlas.

El Consejo se ha mostrado también de acuerdo en la creación de una red europea de información acerca de las enfermedades raras, mediante la cooperación transacional entre grupos de apoyo voluntarios y profesionales. El programa será otado con un presupuesto de 6,5 millones de euros, unos 1.080 millones de pesetas.