Fernando Múgica fue asesinado el 6 de febrero de 1996 de un tiro en la cabeza presuntamente disparado por Xabier García Gaztelu, cuando salía de su despacho, en la calle San Martín, de San Sebastián.

Según el fiscal, Gallastegui, junto con el etarra José Luis Gueresta, esperó en un automóvil a los autores materiales del asesinato, García Gaztelu y Valentín Lasarte. Durante la escapada, los terroristas protagonizaron un tiroto con la Ertzaintza, pero lograron eludir la acción policial.

Por el asesinato de Fernando Múgica sólo ha sido condenado Valentín Lasarte. Xabier García Gaztelu y José Luis Gueresta se encuentran huidos de la justicia.

Además, Juan Luis Aguirre Lete, quien proporcionó a Gallastegui, Lasarte, García Gaztelu y José Luis Gueresta, las armas y la información necesarias para el asesinato de Múgica, se encuentra actualmente preso en Francia.

En caso de que sea extraditada, Gallastegui podría ser cndenada a unos 90 años de prisión por los delitos de asesinato, atentado contra dos miembros de la Ertzaintza, robo con intimidación, depósito de armas y falsedad.