El objetivo del profesor Valverde es que el museo conceda especial atención a los tabajos de carácter científico, ya que las instalaciones irían dotadas de laboratorios y talleres para desarrollar la labor de investigación.

Parte de los fondos expositivos que acogería el nuevo museo ya existen, ya que el propio José Antonio Valverde ha recopilado durante años restos de orcas, pequeñas ballenas, delfines y otras especies de cetáceos que han aparecido en el litoral andaluz.