Según informa Defensa, el hospital fue valorado por la Sociedad Estatal de Gestión Inmobiliaria del Patrimonio en 34,4 millones de euros. En el protocolo de intenciones acordado se establece como forma de pago que la Junta de Andalucía abone al Ministerio alrededor de 6 millones de euros en cuatro plazos, mientras que el resto del dinero se obtendrá mediante contrapestaciones urbanísticas.

Estas contraprestaciones significan la recaificación de unos terrenos pertenecientes al Ministerio de Defensa, todo ello oficializado y regulado dentro del proceso de revisión del Plan General de Ordenación Urbana del Ayuntamiento de Sevilla, motivo por el cual ha sido necesario incorporar al consistorio como parte de la negociación.

El Ministerio de Defensa especifica que ha puesto "especial cuidado" en que se respeten los derechos de los trabajadores del centro hospitalario. En este sentido, el personal civil con titulación sanitaria podrá dcidir entre continuar trabajando en el ámbito del Ministerio de Defensa o ser transferido al Servicio Andaluz de Salud. En este último caso, el Ministerio transferirá también a la Junta la masa salarial correspondiente.

El personal civil no sanitario podrá optar por un puesto de trabajo en el ámbito del Ministerio de Defensa, en Sevilla, o en su entorno inmediato. Al personal civil funcionario se le ofertarán plazas vacantes en Sevilla y al personal militar le será de aplicación la normativa prevista,en la interpretación más favorable que el Reglamento de Destinos permite para el caso de reorganización o cierre de unidades.

El inicio de la negociación que ahora culmina se remonta a primeros de 2001, cuando Defensa estableció los primeros contactos con la Junta, comenzando así unas negociaciones que recibirían el impulso definitivo tras la reunión mantenida en el mes de noviembre de 2002 entre el ministro Trillo y el presidente de la Junta de Andalucía, Manuel Chaves.

A esta reunión siguió un eriodo de negociaciones que ha permitido llegar a un acuerdo sobre un protocolo de intenciones, como paso previo a la firma del convenio de transferencia del hospital a la Junta.