El Real Decreto, que desarrolla la Ley de 2003 sobre técnicas de Reproducción Asistida, establece que el nuevo organismo autónomo estará al servicio de todos los centros sanitarios e investigadores nacionales con la finalidad de promover, coordinar y desarollar las actividades asistenciales y de investigación en los ámbitos de los trasplantes y de la medicina regenerativa para la reparación de los tejidos y órganos dañados mediante la utilización de células troncales humanas de distinta procedencia. biomédica y el tratamiento de numerosas enfermedades en el futuro.

La filosofía de este nuevo Centro es la de aprovechar la excelente estructura de coordinación del sistema sanitario español, a través de la Organización Nacional de Trasplantes, para desarrllar el nuevo campo de la terapia celular y la investigación con células madre.