Los consumidores están en contra de la estructura con que se quiere dotar a la agencia porque ésta sería "poco transparente en el proceso de gestión de la información, ya que apenas daría participación a las distintas organizaciones sociales implicadas en el seguimiento y control de la seguridad alimentaria en nuestro país".

Las organizaciones integradas en el CCU an barajado incluso la posibilidad de no estar presentes en los órganos consultivos de la agencia, "dado el carácter de meros comparsas al que quedarían relegadas en el mismo".

Por otra parte, el Consejo de Consumidores ha pedido la presencia de los responsables de los ministerios de Sanidad y Consumo y de Agricultura, Pesca y Alimentación para que informen de la situación de la enfermedad de las "vacas locas".