El antecedente histórico de este nuevo órgano es la Junta de Jefes de Estado Mayor, que desapareció con la reforma de la Ley Orgánica de la Defensa Nacional de 2005.

El Consejo de Jefes de Estado Mayor está compuesto por el jefe de Estado Mayor de la Defensa (Jemad), que lo presidirá salvo en caso de que asista la ministra de Defensa, y por los jefes de Estado Mayor del Ejército de Tierra, la Armada y el Ejército del Aire, aunque en las reuniones podrán participar, igualmente, las autoridades que eventualmente sean requeridas para ello.

El objetivo es reforzar la autoridad del jefe del Estado Mayor de la Defensa (Jemad) sobre los jefes de cada de los tres ejércitos, a quienes coordinará e impartirá directrices para orientar la preparación de la fuerza, con el objeto de asegurar su eficacia operativa.