A juicio de la Ceapa, el texto inicial de la ley ha sido empeorado en detrimento de la escuela pública y el Ministerio de Educación y Ciencia (MEC) ha vulnerado los puntos que en su día negoció y acordó con esta organización, ya que n incluyen modificaciones que la Ceapa considera vitales para mantener su apoyo.

Según la Confederación de Asociaciones de Padres y Madres de Alumnos, en el texto aprobado por el Congreso de los Diputados el representante de la APA en el Consejo Escolar no aparece por ninguna parte, lo que en su opinión "no es un 'olvido involuntario', sino que responde a un pacto entre el MEC y los sindicatos de profesores, ya que este representante sí aparece en el Consejo Escolar de los centros privados concertadosademás de forma imperativa".

Respecto a los docentes, según la Ceapa, el texto aprobado por el Congreso da al claustro de profesores una atribución excesiva en el gobierno de los centros, mientras que la Confederación de Asociaciones de Padres y Madres de Alumnos defiende la paridad, es decir, "el mismo número de profesores y padres en Primaria, y de profesores, padres y alumnos en Secundaria y Bachillerato".

En cuanto a la dirección de los centros, la propuesta de la Ceapa va encaminada a que e Consejo Escolar conozca con anterioridad a la elección del director qué personas serán las que ocupen los cargos de jefe de estudios y secretario.