El cuerpo del padre Cirujano presentaba indicios de haber recibido fuertes golpes producidos por objetos contundentes, probablemente garrotes, y se encontraba enterrado a poca profundidad en avanzado estado de decomposición.

Su hermana Pilar y su cuñada, Clara Rodríguez, junto con el alcalde de Jaraiz de la Vera, Victoriano Macías y el párroco de la iglesia de Santa María, próxima a la casa donde nació Javier Cirujano y donde ahora vive su madre, se han trasladado hoy a Colombia para hablar con las autoridades y acompañar su cadáver hasta España.

Por el momento, se desconoce la autoría del secuestro y del asesinato, aunque circulan todo tipo de hipótesis, desde que fue secuestrado por militares del Ejércto colombiano, pasando por el Frente Francisco Garnica, facción escindida del Ejército Popular de Liberación (EPL), disuelto en 1991, hasta llegar a atribuirlo a algún miembro del ex grupo guerrillero, hoy partido político, M-19.