El Centro Oceanográfico de Baleares es uno de los centros costeros que el IEO-CSIC tiene distribuidos a lo largo del litoral peninsular e insular. Su principal objetivo es, desde su creación en 1906, investigar los ecosistemas marinos, su funcionamiento y biodiversidad, la ecología de las especies que los componen y sus relaciones con el medio ambiente y la explotación pesquera, desde un enfoque multidisciplinar e integral.

Actualmente, un equipo humano formado por unas 100 personas trabaja para dar respuesta a los principales retos de la oceanografía de hoy: el cambio climático, la conservación de la biodiversidad, el uso y gestión sostenible de los ecosistemas marinos, la protección de hábitats de especial interés, la modelización y la predicción oceánica.