El citado fondo contó con una dotación en 1999 de 138.697 millone de pesetas, un 1,8% más que el año anterior. Andalucía fue la comunidad autónoma que más recibió de ese fondo, un total de 57.397 millones de pesetas, el 41,1% del total, seguida de Galicia, con 24.283 millones (un 17,5% del total).

En el lado opuesto se sitúan Asturias y Cantabria, que percibieron 4.569 y 1.288 millones respectivamente (un 3,3% y un 0,9% en cada caso de la dotación total del fondo).

Sin embargo, si se toma como referencia la variable pesetas por habitante, considerando la mediade población del período 1992-96, Extremadura se sitúa a la cabeza, con 9.831 pesetas por habitante recibidas del fondo, seguida de Galicia (8.899 pesetas por habitante) y Andalucía (8.126 pesetas).

De las diez comunidades autónomas españolas receptoras del Fondo de Compensación Interterritorial, que son las que presentan un menor grado de desarrollo económico dentro del Estado y que coinciden con las regiones incluidas en el Objetivo 1 de los Fondos Estructurales de la Unión Europea, Andalucía, Cantaria, Extremadura, Murcia y Valencia) han aumentado su participación en las dotaciones del fondo en 1999.

Por el contrario, Canarias, Castilla-La Mancha, Castilla y León, Galicia y Asturias han visto disminuir su porcentaje de participación en este fondo.

En cuanto a los proyectos en que se materializan las inversiones financiadas con los recursos del Fondo de Compensación Interterritorial, destacan por su volumen las relativas a transporte terrestre, que supusieron el 27,6% del total, vivienda (1,1%) y educación (10,2%).