El ministerio público acusaba a Arruabarrena del intento de atentado con coche-bomba perpetrado el 3 de enero de 2000 en el bilbaíno barrio de San Adrián contra un transporte de la Guardia Civil. El vehículo cambió de ruta ese día y el atentado no se materializó.

El tribunal ha considerado que a la luz de las pruebas analizadas en el juicio, no se justifica la participación del encausado en estos hechos y ha decidido absolverle. Esta decisión está pendiente de quedar plasmada en sentencia.

Durante el juicio declararon como testigos dos miembros del 'Comando Vizcaya', que no reconocieron a Arruabarrena como integrante del grupo. Se trata de Jon Urretavizcaya y Guillermo Merino, que ya han sido juzgados y condenados por estos hechos. El encausado también negó su participación en el atentado y su pertenencia a ETA.