Médicos Sin Fronteras (MSF) calificó la situación de "grave emergencia humanitaria" y alertó del gran número de desplazados que todavía huyen de los efectos de la guerra con el Norte. La organización calcula que, desde el pasado mes de enero, unos 260.000 nuevos desplazados están viviendo en condiciones "tremendamente acuciantes". Según la coordinadora de emergencias en Sudán, Carole Coeur, se trata de "personas que llegaban en un estado terrible, completamente exhaustas y traumatizadas. Muchas habían visto morir a miembros de sus familias, víctimas de intensos bombardeos".

A la reconstrucción moral y material del país, se unen los problemas sociales que el Gobierno de la nueva República tendrá que afrontar. Distintas ONG aseguran que el nivel de analfabetismo en la zona ronda el 85%.

La salud es otra de las asignaturas pendientes. Médicos Sin Fronteras sostiene que el 75% de la población no puede acceder a la atención sanitaria más básica. Estos escasos recursos sanitarios agravan aún más su tasa de mortalidad materna, la más alta del mundo. Una de cada seis mujeres muere durante el embarazo o parto, según Manos Unidas.